自定义菜单是微信公众平台的核心功能组件。为研究科普教育基地微信公众平台自定义菜单的功能设置及其特点，选取同时开通公众号和服务号的全国自然科学类科普教育基地为研究对象，进行比较分析。研究发现，科普教育基地公众平台的自定义菜单，一般包含信息服务、参观预约服务、互动服务和科普服务等四大功能。同一科普教育基地公众号和服务号自定义菜单设置存在基本一致和错位互补两种情况。认证为企业的科普教育基地公众平台开通并运用了“客服”功能。科普教育基地公众平台的传播力与其自定义菜单设置是否一致并无直接关联。研究从打开率、观众使用体验和有效互动等方面对科普教育基地公众平台自定义菜单设置提出优化建议。